人员编制

截至2022年底，中国科学院昆明动物研究所共有在职职工418人。高级专业技术职称145人，其中正高级职称52人。有中国科学院院士2人，国家杰出青年科学基金获得者11人，国家优秀青年科学基金获得者10人，国家海外高层次人才引进计划青年项目6人，“国家高层次人才特殊支持计划”科技创新领军人才7人，青年拔尖人才1人，科技部中青年科技创新领军人才4人，国家人力资源和社会保障部百千万人才8人，中国科学院杰出技术人才2人 ，中国科学院海外高层次人才引进计划20人，云南省高端人才12人，云南省海外高层人才21人，云南省科技领军人才4人。

中国科学院院士（专职）：张亚平、季维智

国家杰出青年科学基金获得者：姚永刚、徐林、王文、宿兵、赖仞、毛炳宇

科研部门

据2023年11月研究所官网数据，中国科学院昆明动物研究所设有生物多样性中心、进化发育中心、灵长类中心、资源利用中心4个研究中心，共计44个学科组；拥有多个国家或院级科研与技术平台，与香港中文大学联合共建生物资源与疾病分子机理联合实验室，并拥有2个野外观测台站。

国家重点实验室：遗传资源与进化国家重点实验室

中国科学院共建重点实验室：中国科学院、云南省动物模型与人类疾病机理重点实验室

云南省重点实验室：云南省畜禽分子生物学重点实验室、云南省动物生殖生物学重点实验室

所属联合实验室：中国科学院-英国安东格里亚大学生态学与环境保护中心、中国科学院昆明动物研究所-香港中文大学生物资源与疾病分子机理联合实验室

所属研究中心或实验室：中国科学院昆明灵长类研究中心、西南生物多样性实验室

设施资源

仪器设备

据2023年11月区域中心官网数据，中国科学院昆明动物研究所所属的昆明生物多样性大型仪器区域中心拥有同位素质谱仪、超高效液相色谱质谱联用仪、人工气候室、全自动旋光仪、圆二色光谱仪、气相色谱/质谱联用仪、气相色谱仪、x射线单晶衍射仪、超低温探头超导核磁共振波谱仪、液相-离子阱色谱质谱联用仪、超高效液相色谱/三重四极杆串联质谱联用仪、三扇型磁质谱仪、高效液相色谱仪、x射线单晶衍射仪等多个仪器设备。

馆藏资源

据2023年11月区域中心官网数据，中国科学院昆明动物研究所所属的昆明动物博物馆标本馆与研究所同期建于1959年初，保存有大量云南及西南地区的动物标本，是博物馆的基础和重要组成部分。

标本馆贮藏面积2111·12平方米。储藏区包括兽类库、鸟类库、两栖爬行库、鱼类库和昆虫库，标本保存方式有：浸泡、干壳、剥制、冷藏等。标本馆现馆藏各类动物标本约95万号，其中模式标本超500种/亚种5，161号，涵盖了云南“动物王国”和临近省区几乎所有生态类型的动物标本。

合作交流

国际合作

据2023年11月研究所官网数据，中国科学院昆明动物研究所先后与美洲、欧洲等多个国家的科研机构开展合作，并积极参与中国科学院“中非联合研究中心”和“东南亚生物多样性研究中心”的建设，进一步拓展了与非洲和东南亚的合作。

国内合作

2020年6月16日，中国科学院昆明动物研究所与昆明市延安医院举行战略合作协议签约仪式。

2023年7月7日，昆明市园林绿化局与中国科学院昆明动物研究所，举行了涵盖动物保护、动物医学等多个领域的科技合作签约仪式。

荣誉表彰

2022年5月，昆明动物研究所生物安全三级实验室获得“中国科学院青年五四奖章集体”称号。