2015年，经广东省政府批准，研究院被第一批认定为广东省新型研发机构。下辖研发中心及专业实验室17所，其中包含3所国家重点实验室及工程中心深圳研发平台，5所深圳市重点实验室。拥有研究人员600+人，产学研经费rmb 6+亿元，多年来承担了超过900+项国家、省市及香港的科研项目，如国家973及863计划、国家自然科学基金重大研究计划、广东省粤港关键联合项目、深圳市重大产业技术攻关等重大课题及香港创新科技计划等。在nature、science等世界一流学术期刊上发表论文一千多篇，获得多项专利授权，涌现一批优秀科技成果，多项研发成果更获得国家及深港两地政府的支持和奖项，包括国家科技发明奖、教育部科技进步奖、香港工商业科技成就奖、深圳市科技创新奖、深圳市自然科学奖等。

城截至大与内地“双一流”高校在深圳研究院开展联合培养博士研究生项目，签约学校包括中国科学技术大学、西安交通大学、中国科学院大学、南京大学、浙江大学、复旦大学、中国人民大学、上海交通大学、哈尔滨工业大学以及南方科技大学等国内知名高校，2023底，在读联合培养博士研究生共510人，已获得博士学位人数达到663人。