（一）办公室。负责机关日常运转工作；承担机关党的建设、党风廉政建设、意识形态、群团和精神文明建设工作。负责机关人事、财务、文电、机要、档案、保密、信访、党务政务公开、信息化建设、新闻宣传、后勤服务保障等工作。负责综合性材料的起草，规范性文件审核工作；承担各类会议、重要活动的组织协调工作。负责水利资金的监督管理和内部审计工作。

（二）规划建设管理室。负责拟订全市水利发展规划并组织实施。负责水利重大政策、决策部署和重点工作的贯彻落实。组织指导有关防洪论证工作。组织实施水利基础设施项目前期工作、工程建设及后期评估管理工作。负责水利统计、项目稽察工作。负责水利工程建设管理，组织水利工程招投标。负责水利建设市场的监督管理和信用体系建设。组织实施水利工程质量和安全监督。负责水利行业安全生产工作。负责水利行业对外合作与交流工作。

（三）法规与水资源管理室。负责水政监察和水行政执法工作。承担水利突发公共事件的应急管理工作。组织查处重大水事案件、调解重大水事纠纷，负责行政审批、行政复议、行政应诉和行政赔偿等工作。负责规范性文件的合法性审查及报备工作。负责普法、法治政府建设、平安建设工作。

落实最严格水资源管理制度，组织编制水资源保护规划，指导饮用水水源保护有关工作；组织实施取水许可、水资源论证制度，开展水资源有偿使用工作。负责编制全市节水规划，组织开展节约用水工作。落实用水总量和用水效率控制制度，推动节水型社会建设。拟订全市河湖管理保护有关政策、技术标准、保护规划，负责监督实施全市河湖、水域及其岸线的管理、保护、治理工作。负责水行政管理体制改革有关工作。负责水利社团有关工作。承担全市全面推行河长制办公室日常工作。

（四）农村水利与水保室。组织开展大中型灌排工程建设与改造，负责现代化生态灌区建设管理，负责节水灌溉有关工作。负责水利改革统筹协调及农业水价综合改革有关工作。负责农村水利社会化服务体系建设。指导农村饮水安全工程建设管理工作。负责全市水土保持工作，开展水土流失综合防治、监督管理和监测评价。承担重大建设项目水土保持方案的审查审批、监督实施及水土保持设施的验收工作。承担水利工程移民管理和后期扶持工作，组织开展新增水库移民后期扶持人口核定和政策落实。