办公室

负责机关日常运转，承担文秘、信息、政务公开、信访、会务、机要、保密、档案、安全、后勤、制度建设、建议提案、督查督办等工作。组织起草综合性材料、重要文件。承担机关和直属单位综治维稳、平安创建、安全生产监督管理工作。牵头研究提出深化医药卫生体制改革的重大方针、政策、措施的建议，指导、推进卫生健康重大改革工作，牵头推进公立医院综合改革工作。牵头承担区深化医药卫生体制改革的具体工作。牵头承担基层医疗卫生体制机制改革工作。

组织人事科

拟订卫生健康行业人才队伍建设的规划、政策并组织实施。负责机关和直属单位的干部人事管理、机构编制工作，负责离退休干部服务管理工作。承担人大代表和政协委员推选、农村指导员选派等工作。承担卫生健康思想文化建设工作，负责全区卫生健康系统意识形态工作。承担精神文明建设工作，牵头本系统文明城市和文明单位创建工作。组织指导全区卫生健康领域的对外交流与合作工作，承担机关和直属单位外事管理工作。牵头承担系统对口支援和协作合作工作。牵头负责行业作风建设。牵头承担区本级公立医院党建工作，指导系统党建工作。组织指导卫生健康宣传、新闻和信息发布工作。

法规科（挂政务服务科牌子）

承担规范性文件的合法性审查、公平竞争审查等工作，承担行政复议、行政应诉等相关工作。承担卫生健康信用体系建设工作。承担卫生健康普法工作。承担卫生健康政务服务“最多跑一次”改革工作。承担行政审批制度改革相关工作，承担区级卫生健康行政许可等审批事项的统一受理、形式审查和制证发照等职责。负责管理区卫生健康局政务服务窗口

财务审计科

承担机关和预算管理单位的预决算、财务、资产管理、内部审计和绩效评价工作，提出医疗服务价格、药品价格、基本医疗保险费用结算等政策建议。

综合监督科

承担公共卫生、医疗卫生、职业卫生等监督工作，组织查处医疗服务市场重大违法案件。组织开展医疗服务、传染病防治、精神卫生、饮用水卫生、职业卫生、公共场所卫生、学校卫生监督执法检查。完善卫生健康执法监督体系，组织稽查考评，指导规范监督执法行为。承担医疗废弃物管理工作。承担职业安全健康监督管理工作，协调开展职业病防治工作。

医政医管科（挂中医药管理科牌子）

拟订全区医疗行业管理的相关政策、标准、规范并监督实施，承担推进护理、康复事业发展和献血管理工作。承担全区医疗服务及其质量安全监管工作。拟订公立医院运行监管、绩效评价和考核制度并组织实施。拟订基层卫生健康政策、标准和规范并组织实施，指导全区乡村医生管理工作。承担基层医疗卫生机构监督管理职责，负责基层医疗卫生机构准入、医疗技术应用、医疗质量和安全等，承担基层医疗卫生机构体系建设的实施工作。组织实施基本药物制度，拟订执行基本药物的相关政策和规定，开展药品使用监测、临床综合评价和短缺药品预警。承担医疗卫生领域“最多跑一次”改革工作。拟订全区中医药（中西医结合）事业中长期发展规划并组织实施，制定中医药行业管理政策、标准、规范并监督实施。组织和指导全区中医药科技创新发展，负责中医药人才队伍建设。组织开展中医药文化继承、传播、发展和合作。参与拟订全区中医药产业发展规划、产业政策和中医药扶持政策。拟订卫生健康科技发展规划及相关政策并组织实施。承担实验室生物安全监督和伦理审查工作。承担卫生健康专业技术人才选拔、培养。组织开展住院医师、专科医师培训等毕业后医学教育和继续医学教育工作。

规划发展与信息化科

组织拟订全区卫生健康中长期发展规划并组织实施，承担统筹规划与协调全区卫生健康资源配置，指导、推进卫生健康服务体系和信息化建设。承担卫生健康政府数字化转型工作。促进健康服务业发展。承担大型医用设备配置审核转报和装备管理。承担卫生健康统计工作。指导督促全区卫生健康系统基本建设工作。承担监督直属单位节能减排工作。

人口监测与家庭发展科

承担人口监测预警工作并提出人口与家庭发展的政策措施建议。完善生育政策并组织实施，建立和完善计划生育特殊家庭扶助制度，实施计划生育奖特扶政策，开展出生人口性别比治理。

健康促进与评价科

牵头研究提出健康瓯海建设、爱国卫生运动的规划、政策、措施的建议，组织开展健康瓯海和爱国卫生运动考核评价工作。组织开展卫生健康教育与促进活动，承担卫生健康科学普及工作。承担区健康瓯海建设办公室、区创建国家卫生城市办公室、区爱国卫生运动委员会办公室的日常工作。

干部保健科

拟订干部保健工作规划；承担重要会议与重大活动的医疗保障工作；干部保健医疗经费归口管理和审核工作；负责管理区级机关事业单位相关工作人员健康体检工作，建立健康档案（保健对象的健康信息收集、反馈和统计工作）；负责落实健康体检基地，现场组织、监督及体检人数核对工作；负责干部保健定点医院和干部保健相关业务指导工作；负责干部医疗保健专家的工作联络专家队伍资格审核、聘任工作。