重庆市九龙坡区人民检察院的前身是1954年3月29日成立的重庆市人民检察署第一工厂区专门检察署，办公地点位于101厂新建国院2号。

1955年10月13日，更名为重庆市第四区人民检察院，院址迁至李家沱林荫村204号。同年10月24日“重庆第四区”更名为“重庆市九龙坡区”，10月30日，第四区人民检察院更名为九龙坡区人民检察院。

1978年10月，九龙坡区人民检察院恢复重建，

1998年10月，迁址于杨家坪毛线沟杨渡村6幢。

2003年12月6日，迁址于九龙园区红狮大道2号新建办公大楼。