（一）办公室

协助局领导处理日常政务工作，负责机关重要会议的组织；重要报告和综合性文件起草；负责机关文秘、信息、机要、印鉴管理，信访、档案和政策法规研究；负责全市交通系统行政执法工作；综合协调、督促、检查机关工作；承办局领导交办的其它工作。

（二）人事劳动科

负责局机关和局直属单位的人事、机构编制、劳动与社会保障等有关工作；负责全市交通系统专业技术人员的资格评审上报工作，完成自治区交通厅人事处及市委组织部有关科室交办的工作。

（三）计划统计科

组织编制公路、水路交通运输行业发展和技术改造中、长期规划，并对执行情况监督检查；负责基本建设和技改项目的立项审查、前期工作和后期评估；组织编制交通部门年度公路建设养护、运输生产计划，并对执行情况监督、检查；负责交通行业基本情况统计、调查、分析和统计资料的汇编；负责港航设施建设使用岸线的布局规划及审查工作；统筹安排公路工程建设项目设计的审查、项目实施管理和竣工验收工作。

（四）财务审计科

编制、审核局属事业费预算、基本建设投资等各项财务计划、预算，并检查执行情况；审批、编制局属单位及旗（市、区）交通系统的会计预、决算，养路费收支计划；协调、安排全市交通系统财务收支计划；负责对全系统机关、事业单位的国家财产、财务收支、经济效益进行审计监督；负责对交通部门管理的专项资金收支和交通建设投资进行审计监督工作。

（五）科技教育科

拟订交通行业科技、教育中长期发展规划及年度计划并组织实施，推进科研、教育体制改革；负责交通科技项目的实施；管理交通行业标准和计量工作；负责普法教育和交通系统行业执法教育培训工作。

（六）交通战备科

承担市交通战备办公室的日常工作；负责交通战备建设、交通保障规划、计划、交通战备预案的制定和实施；组织协调管理应急交通战备队伍。

（七）公路运输科

负责全市公路、水路客货运输、出租汽车、汽车维修行业管理和宏观调控；负责口岸涉外运输管理，开展国际交通合作与技术交流；负责汽车驾驶员培训工作的行业管理工作。

纪检委。负责市交通局及市交通系统纪律检查工作。

机关党委。负责市交通局及直属单位党务工作。