1955年10月，河南省白马寺水利学校创建。

1957年2月，迁至郑州市陇海西路校址，改名为河南省水利学校。

1958年8月，学校升格为郑州水利专科学校、河南水利学院。

1962年6月，专科停办，更名为郑州水利学校。

1970年12月，学校停办。

1978年1月，学校复校。

1984年7月，更名为河南省郑州水利学校。

1985年10月，迁至郑州市花园路现址。

2002年7月，经河南省人民政府同意、河南省教育厅批准，学校与华北水利水电学院合作举办华北水利水电学院水利职业学院。

2012 年 6 月，撤销河南省水利干部学校，河南省水利职工培训学校并入河南省郑州水利学校。

2013年3月，河南省政府批准将华北水利水电学院水利职业学院从华北水利水电学院剥离，设置河南水利与环境职业学院，独立举办高职教育。

2015 年，开启航空港校区建设工作。

2015年，学院被认定为河南省职业教育品牌示范院校。

2017 年 8 月，河南省郑州水利学校、漯河水利技工学校、信阳水利技工学校撤销整合，学校新增漯河校区、信阳校区。

2018年，学院被水利部认定为全国优质水利高等职业院校建设单位，被教育部认定为第三批现代学徒制试点单位，被河南省教育厅认定为河南省优质高等职业院校立项建设学校。

2020 年航空港校区初步建成并投入使用，10 月迎来首批学生。

2020年4月21日河南水利与环境职业学院与华教教育科技（江西）有限公司（郑州城轨交通中等专业学校）联合组建混合所有制二级学院—-河南水利与环境职业学院城轨交通学院。

2021年9月30日，通过教育部职业教育与成人教育司组织的现代学徒制第三批试点验收。