根据《宁夏检察机关内设机构改革实施方案》，大武口区人民检察院设置内设机构7个。

1·检察办案部门共5个。分别为：

侦查监督部（原侦查监督科）：负责对本院刑事犯罪案件犯罪嫌疑人的审查批捕、立案监督、侦查活动监督以及刑事司法与行政执法相衔接工作。结合办案参与社会治安综合治理以及法律规定或者检察长交办的其他工作。

公诉部（原公诉科）：负责案件的审查起诉、侦查活动监督、出庭公诉及刑事审判监督工作；统一办理本院受理的全部刑事案件的审查起诉、抗诉、核准追诉、报请核准追诉等案件；研究制定工作细则、规定。

未成年人检察部（原未成年人检察科）：负责办理涉及未成年人刑事案件的审查批捕、审查起诉、出庭公诉及侦查监督、审判监督工作；承办涉及未成年人的控告申诉检察、民事检察、行政检察、刑事执行检察等案件及法律监督工作；开展对涉罪未成年人教育、帮教、考察、矫正工作；开展未成年人的法治教育、宣传及犯罪预防工作；参与涉及危害未成年人权益的重大事项，必要时提起或指导提起公益诉讼；协调有关单位和部门开展未成年人案件办理和社会化支持体系建设；研究制定未成年人检察工作有关规定。

诉讼监督部（原民事行政检察科）：负责办理民事执行监督、民事调解监督案件；办理本院受理的行政诉讼监督、公益诉讼、行政强制措施监督、行政执行、立案监督和非诉行政执行案件监督以及行政不作为、乱作为监督等案件；对同级人民法院已经发生法律效力、确有错误的民事、行政判决和裁定，按照审判监督程序向上级人民检察院提出抗诉；研究、分析本院办理的民事诉讼监督、行政监督工作中的重大、疑难问题，提出工作对策，研究制定工作机制。

控告申诉检察部（原控告申诉检察科）：处理来信来访；受理控告、举报、申诉，接受犯罪嫌疑人自首；管理举报线索，初核举报线索，审查不立案的举报线索；审查办理对公、检、法三机关及其工作人员阻碍辩护人、诉讼代理人依法行使诉讼权利的控告或申诉；审查办理对本院办理案件中违法行为的申诉或者控告；办理刑事申诉、国家赔偿案件；开展司法救助工作。

2·综合业务部门1个。

业务管理部（原案件管理办公室、检委会）：统一受理本院直接立案管辖的案件、统一分流案件、统一办理内部流转、统一办结登记、统一负责案件对外移送的审核工作；对本院办案工作运行态势进行综合分析、研判，提出有针对性的对策建议；承办本院检察委员会的日常工作；承办有关检察工作法律、法规议案的征询意见工作；制定本院业务管理工作细则、规定。负责检察基础理论研究工作，调查研究国家公布的与检察工作有关的法律、法规、政策的执行情况，为检察长决策提供意见。

3·司法行政部门1个。

综合保障部（原政工科、办公室、法警队、技术室）：

政工党务工作职责：负责全院的思想政治工作；负责检察机关的干部考核、任免、调配、人事档案管理、人事统计工作；负责干部教育培训工作；负责检察新闻宣传工作；负责组织开展上级检察院安排部署的专项活动；组织协调各部门开展普法工作；协助本院党组、党支部、工青妇加强机关党的建设、队伍建设和检察文化建设；负责党的思想、组织、作风建设和纪律检查工作。

行政管理工作职责：负责本院重要文件的起草、信息简报编发、文件流转等文秘工作；负责组织召开综合性会议的筹备、联络和会务等工作；负责档案管理及机要保密工作；协助院领导处理检察政务，组织协调院重要工作部署、重大决策的贯彻实施；负责与人大代表、政协委员沟通联系；组织协调院内重要工作部署、重大决策的贯彻实施并进行督办；负责统筹接受外部监督，组织协调检务公开工作；负责机关的财务、后勤、综合保障工作。

纪检监察室：协助党组书记、检察长抓好本院党风廉政建设和反腐败工作，主持全院党风廉政建设责任制的日常工作和领导干部廉洁自律、违法违纪案件查处、纠正行业不正之风三项任务的组织和协调工作。组织开展职业道德和职业纪律教育、适时进行作风整顿；严格教育、监督全院工作人员公正执法、文明执法和廉洁执法；组织开展检务督查工作。

技术工作职责：负责本院检察技术及信息化应用工作；负责本院门户网站及检察专网的信息维护以及网络舆情监控工作。

司法警察职责：制定司法警察管理的规章制度并组织实施；组织司法警察的管理、培训；管理司法警察警用装备；协调跨区域的重大警务活动；负责全院检察机关办案区管理工作，使用并提供警务保障以及安全保卫工作；完成检察长交办的其他任务。