医院有经八路综合院区（设有床位2000张）、南阳路郑州大学眼耳鼻喉医院院区（设有床位300张）和郑州市经开区院区三个院区。

一、郑州大学第二附属医院北院区位于河南省郑州市南阳路32号。

二、郑州大学第二附属医院经开区院区（建设中）位于河南省郑州市经开区。