常绿针叶林

中国科学院武汉植物园常绿针叶林主要是马尾松林，位于磨山园区植物园的中心地带，占地面积约17000平方米。马尾松林是中国东南部湿润亚热带地区分布最广、资源最大的森林群落，也是该区域海拔1000米以下常见典型森林群落类型。

三峡植物区

三峡植物区建成于2005年，占地面积6670平方米，位于磨山园区。该区以展示和保存三峡库区消涨带植物为主，其中三峡特有植物50余种，如疏花水柏枝、秋花柳、宜昌黄杨、中华蚊母、小叶蚊母、瑞香、绵枣儿等，典型植物群落5个。该区为三峡库区消涨带耐水淹植物提供了安身之所，也体现出植物学家在应对三峡工程对地区环境影响的努力。

杜鹃园

杜鹃园始建于1991年，占地面积约3000平方米，位于磨山园区，共收集展示杜鹃原种12个，各类品种100余个。杜鹃园最具代表性的是1981年从利川毛坝引种的“野生杜鹃王”鹿角杜鹃，高达4·5米，同时有早春独树一帜的满山红桩景，稀有黄花色的羊踯躅。

花境大道

花境大道始建于2012年，后不断延伸和扩建，拥有面积约3500平方米，位于磨山园区的中轴线上。东起蔷薇园，西至标本馆，全长约500多米。毗连水生植物区、山茶园、木兰园、松柏园、三峡消涨带等专类园区，共栽培植物400余种（含品种）。

月季园

月季园经过多年的景观优化，展示面积为1500平方米，位于磨山园区，主要环绕在荷花睡莲品种展示区周边而建，另在野果园、药园等全园呈点状分布。园区栽培保育的月季种类有大花香水月季系列、微型月季、树状月季、地被月季等，共计200余个品种7000余株。月季园将不同类型的月季组团栽种，同时与廊架、拱门、墙体有机结合，形成丰富的景观效果。

（注：该词条仅介绍部分主要景点，其他景点介绍详见）