姚檀栋：名誉所长，指导研究所的建设与发展。

庄绪亮：党委书记、副所长（主持工作）。

丁林：学术副所长，负责研究生教育、推动国家重点实验室建设。

董伟锋：党委书记兼副所长，负责党建和创新文化、行政后勤、基建修缮、资产管理、安全保卫等工作，协管人事人才工作。分管综合人事办公室、条件保障处。

李洪伟：党委副书记、纪委书记。

安宝晟：副所长，负责财务管理、对外合作（研究所与地方以及其他科教单元）、重大项目管理、科普宣传等工作。分管财务计划处。兼任拉萨部主任。

李新：副所长

徐柏青：副所长