中心承担全市各类传染病、慢性非传染性疾病及有关常见病的防治，消毒及病媒生物控制，食品、化妆品、涉水产品、一次性医疗卫生用品等与人民健康密切相关的生活用品的卫生学检测、评价及劳动卫生和职业病防治、放射防护、从业人员预防性健康检查、建设项目预防性卫生学评价等预防医学领域工作，全市重大活动的公共卫生保障工作，承担对全市传染病疫情、污染、中毒等突发公共卫生事件的调查处理、应急控制和救灾防病工作。

中心有设备先进的万级（局部百级）净化室、原子吸收实验室、艾滋病初筛中心实验室、气相色谱室、离子液相色谱室等专用实验室。固定资产2000万元。中心有15个内设机构。

永州市疾病预防控制中心将在市委、市政府和市卫生局的领导下，继续贯彻“预防为主”的方针，全面加强与省内外疾控机构、科研院所和社会各有关方面的合作，充分利用自身的技术与设备优势，广泛开展疾病预防控制与公共卫生技术研究，承担预防保健、公共卫生领域的技术咨询与技术服务，为社会提供各类产品的卫生检测、出证与技术仲裁，参与社区卫生服务，实施健康教育和疾病预防控制知识的宣传普及工作，开展预防保健门诊服务。充分发挥疾病预防控制的技术决策和保障功能，随时做好救灾防病和处理重大传染病疫情及突发公共卫生事件的准备，为推动全市卫生事业发展，保障人民身体健康，促进全面建设小康社会和社会主义和谐社会作出更大贡献。