2014年，新疆科技职业技术学院经新疆维吾尔自治区人民政府批准设立；同年4月，中华人民共和国教育部发布《关于公布专科学历教育高等学校备案名单的函》，新疆科技职业技术学院在列，该函显示其为民办院校，学校举办者是新疆星启航网络科技有限责任公司。同年7月，中华人民共和国教育部、中华人民共和国发展改革委联合发布《关于下达2014年全国普通高等教育招生计划的通知》，新疆科技职业技术学院被允许招生。

2024年12月，学校当选为西北四省区高校毕业生就业协会数字产业与就业联盟牵头单位。