创立初期

1952年，西北中医进修学校在西安成立。

升格搬迁

1959年，学校升格为陕西中医学院。

1961年，学校迁至咸阳。

1978年，中共中央56号文件确定陕西中医学院为全国8所重点建设中医院校之一。

1981年，被国务院学位委员会批准为首批硕士学位授予权的高等医药院校。

更名发展

2015年4月24日，陕西中医学院更名为陕西中医药大学。同年4月28日，被批准为“卓越医生（中医）教育培养计划”改革试点高校。

2021年7月23日，陕西省人民政府和国家中医药管理局签署《共建陕西中医药大学协议》。

2022年，学校入选陕西省国家高等教育智慧平台试点高校。

2023年6月，陕西中医药大学廉洁文化研究中心揭牌。

2023年12月，浙江中医药大学发起成立全国中医药数字化教学联盟。

2025年2月，陕西中医药大学召开归国华侨联合会成立大会暨第一次归侨侨眷代表大会。3月26日，新疆第二医学院与陕西中医药大学签署战略合作框架协议。4月2日，陕西中医药大学妇女联合会成立。4月9日，陕西中医药大学科协成立。6月25日，深圳市中医肛肠医院（福田）与陕西中医药大学正式签署战略合作协议，揭牌成立“陕西中医药大学深圳研究院”。