根据上述职责，市人民政府国有资产监督管理委员会设6个科室：

（一）办公室（与党委办公室合署）

负责文电、会务、机要、档案、督办、安全保卫等机关日常工作；承担信息、保密、财务、行政后勤管理服务等工作；承担委党委的日常工作；承担相关的宣传和新闻工作；负责委机关工、青、妇及计划生育工作；负责协调企业有关事务和各科（室）做好所监管企业的信访工作。

（二）综合法规科

研究总结国有资产体制改革的实践经验；起草有关重要文稿；研究国有企业改革和发展中有关法律问题，起草有关地方性法规、规章草案及规范性文件；承担机关有关规范性文件的合法性审核工作；指导所监管企业法律顾问工作，参与审核所监管国有独资公司章程；承办机关法律事务；联系和指导所监管企业董事会建设工作；参与对需要国有股东决定的事项或派出董事的报告事项提出意见；参与改革融资和企业债务重组工作；负责指导督查所监管企事业单位计划生育、安全生产、社会治安综合治理工作。

（三）产权管理科（财务总监办公室）

研究拟订企业国有资产产权界定、登记、划转、处置及产权纠纷调处、国有资产收益等规章制度并组织实施；审核企业国有资本金变动和使用、股权转让及发债方案；负责收缴企业产权转让收益，并对产权转让收益的使用管理提出意见；审核企业资产评估项目；负责监缴企业国有资产收益，并对资本收益的使用管理提出意见；监督、规范国有产权交易；承担所监管企业资产损失核销工作；负责企业财务总监日常管理工作。

（四）考核与统计评价科（审计室）

负责企业国有资产经营预算管理；完善所监管企业负责人经营业绩考核制度，对所监管企业负责人进行年度和任期考核；建立和完善国有资产保值增值的考核办法；建立健全国有企业绩效评价指标体系，综合考核所监管企业的经营业绩；研究提出所监管企业重大资产损失责任追究的意见和措施；提出国有企业收入分配制度改革的指导意见；拟订清产核资的政策规定并组织实施；承担所监管企业国有资产统计、运行情况分析和预测工作；负责国有资产管理材料的综合工作；负责组织实施对所监管企事业单位负责人经济责任审计工作；指导所监管企事业单位的内部审计工作；承办向所监管企业派出监事会的工作，承担监事会的日常管理工作。

（五）企业改革和重组科

研究提出国有企业改革的政策建议；指导国有企业的现代企业制度建设；审核企业合并、股份制改造、上市、合资等方案和国有资产经营公司的组建方案，对其中需要国有股东决定的事项提出意见；承办所出资的国有独资公司章程的审核工作。参与改革融资和企业债务重组工作；指导所监管企业主辅分离、辅业改制和富余人员分流工作，配合有关部门做好下岗职工的安置工作；推进所监管企业厂办大集体的改革工作。

（六）组织人事科（监察室）

负责机关人事管理、机构编制、劳动工资、职称、离退休人员服务等工作；负责机关和所监管企事业单位的纪检、监察和党风廉政建设工作；负责机关和指导所监管企业党的建设工作；负责协调指导所监管企业的工会、青年、妇女工作；指导所监管企业思想政治工作、精神文明建设和企业文化建设工作；指导所监管企业的统战工作和知识分子工作。根据有关规定，承担对所监管企业领导人员的考察工作并提出任免建议；考察推荐董事、监事及独立董事人选；提出选派企业监事会主席、专职监事和财务总监人选；拟订向市属国有控股和参股公司派出国有股权代表的方案。