重庆市荣昌区人民检察院前身为1951年11月成立的荣昌县人民检察署。

1955年，正式更名为荣昌县人民检察院。

文革中受到严重冲击，检察机关陷于瘫痪状态，于1975年被撤销。

1978年10月，恢复重建，院址设于县城昌元镇东益当3号。

1999年4月16日，院址迁于昌元镇海棠大道中段，2008年5月办公楼在汶川大地震中严重损毁成为危房。

2011年，历时1年零7个月，占地面积7000余平方米的新办公大楼竣工，同年5月25日荣昌县人民检察院迁入位于昌元街道向阳路159号的新址办公。

2015年6月18日，因荣昌撤县设区，重庆市荣昌区人民检察院挂牌成立。