山门

南少林寺只有一个山门，也可称之为三门。正门上方有长方形红底金字书写的“少林寺”三个字。

天王殿

南少林寺中的天王殿供奉着弥勒菩萨，四大天王（持国天王、增长天王、广目天王、多闻天王）、韦陀菩萨和诗人天干、弥写甚萨。

大雄宝殿

大雄宝殿是南少林寺的核心建筑，殿内塑有佛像，从佛手印上来看应为三身佛，南无消灾延寿药师佛、孝周牟尼佛和阿弥陀佛。两侧分列十八罗汉。后殿供奉西方三圣（阿弥陀佛、观世音菩萨、大势至菩萨）和文殊菩萨（骑狮）、普贤菩萨（骑象）。

观音殿

观音阁三层楼高约22米，是按照闽南传统古建筑风格建造阁内供奉的“荷瓶观音”圣象，是全国最大红木雕观音圣像，采用两块非洲菠萝格红木材料雕成。荷花观音脚踩荷花，手持摩瓶。

藏经阁

藏经阁为闽南传统建筑风格的土木石两层楼式建筑。

方丈楼

方丈起居及接待重要宾客的场所为方丈楼，原指禅寺住持之居室，转申为禅林住持之尊称。

钟楼、鼓楼

钟楼、鼓楼是寺院每日晨昏鸣钟击鼓的场所。 早晨先敲钟后击鼓，晚上先击鼓后敲钟，故有“晨钟暮鼓”的说法。

文殊阁

文殊阁供奉的是文殊菩萨，文殊菩萨是如来佛祖怙恃之一 文殊菩萨又称法王子，为智慧之象征。

普贤阁

普贤阁供奉的是普贤菩萨，守护世人身心安稳，不受一切烦恼魔障之侵。

演武堂

少林武僧进行武术表演和交流文化活动的场所。

五观堂

少林寺僧众与信众食用斋饭的地方。