（一）办公室。负责机关日常运转工作，承担文电、会务、机要、信息、保密、档案、政务公开等工作；承担机关联络接待、综合协调、督察督办等工作；完成市委、市政府及局领导交办的其他工作任务。

（二）行政审批科。承担全局政务服务运行管理，负责规定权限内交通运输政务服务事项的统一受理、审批、协调和督办等相关工作；负责组织、指导、监督政务大厅分中心工作；负责在职能范围内贯彻落实国家、省、市关于“放管服”工作相关政策和措施。

（三）行业管理科。负责拟订全市道路运输、公路、水路发展规划和相关管理制度；承担全市道路运输行业、港口、公路路政、公路养护等管理和客运车辆安全操作规程及服务标准等方面的技术指导；承担综合运输协调与衔接工作；组织做好全市燃油消耗信息申报和补贴发放；组织落实指令性及重点运输任务；承担交通基础设施建设市场管理工作；承担全市公路路网运行监测和协调工作；指导农村公路建设及管理工作。

（四）法制科。参与承担有关立法规划和协调工作；承担有关规范性文件的合法性审查、行政复议和行政应诉等相关工作；监督指导全市交通运输综合行政执法工作；负责信访维稳工作；负责跨区域执法的组织协调工作。

（五）财务审计科。负责组织制定全局财务、会计规章制度，指导局属单位财务工作，对系统财务工作进行检查监督；负责财务核算、决算、拨款及国有资产的管理工作；制定交通基本建设资金监督管理工作规章制度和管理办法并监督实施；承担交通基本建设资金监督工作；承担局属单位领导干部经济责任审计工作；负责局属单位国有资产保值增值、财务收支、经济效益及局投资项目的审计工作；承担局属单位资金监管工作；指导交通行业内部资金监督工作。

（六）安全监督应急科。人事劳动科与其合署办公。贯彻落实安全生产法律、法规和各项方针政策；负责全局安全管理、指导、检查、监督工作；依法组织或参与有关事故调查、伤亡事故统计分析工作；负责对交通各类突发公共事件及重大疫情防预的指挥、组织、救援工作；负责交通各项应急预案的制定、演练、启动、指挥工作；负责交通战备物资的储备、调拨工作，指导、检查、监督国防交通和国防动员等工作，承担军地沟通协调等有关工作。负责机关和局属单位的人事、机构编制、劳动工资、人才队伍建设等工作；

（七）计划信息科。负责编制全市综合交通运输体系规划，组织起草行业发展规划，参与拟定物流业发展规划，组织编制有关计划；负责有关规划和建设项目前期立项审查申报和后期评价工作；承担交通运输调查和综合统计工作；负责全系统网络安全和信息化建设指导工作；负责有关交通运输环境保护、节能减排、利用外资、信用体系建设、科教等工作。

机关党委。其办事机构与办公室合署办公，负责机关及局属单位的党群工作。