1993年，学校获批筹建。

1996年4月，广东省人民政府批准成立番禺理工学院。

1997年6月，学校更名为番禺职业技术学院。9月，学校获国家教育委员会正式备案，学校由广州市和番禺市人民政府共同管理，由番禺市直接管理。

2006年，学校实行“市区共建，以区为主”的管理体制。

2008年，学校更名为广州番禺职业技术学院。

2009年，学校获批为国家示范性高等职业院校。

2010年，学校变更为“市区共建，以市为主”的管理体制。

2019年7月，被教育部认定为全国“优质专科高等职业院校”。

2025年6月，教育部同意以广州番禺职业技术学院为基础设立广州职业技术大学，为公办本科层次职业学校，同时撤销广州番禺职业技术学院建制。