学校标志

校徽

蛇杖代表医业和医学的神圣，是国际通用的医学标志，辟邪是南京的象征，表明地理位置，与其他在宁高校相统 。书卷代表教学科研，象征高校。盾，古代防护之兵器，盾形既传统又威严。发射的光芒，寓意前程似锦，蒸蒸日上。 浅，既给人视觉享受，又体现刚柔相济、阴阳农合。1934特指创校时期。

精神文化

校训

南京医科大学的校训为“博学至精，明德至善”。博学，意指学问丰富。至是达到。精，精深、完美之意。博学至精，指通过广泛的学习，掌握广博的知识，达到精通专业、臻于完美的境界。明德，意指通晓道德，至是达到。善，善良、高尚之意。明德至善，指通过品德修养，明确道德责任，达到高尚的境界。

博学、明德，是寄望师生既在学业学术上有所成就，又追求美好的道德情操，品学兼优、德术双馨。至精、至善，是表明博学、明德的目标，以激励师生不断以高标准要求自己，锲而不舍、追求卓越，努力达到完善之境界。

校歌

学生社团

中外交流协会

南京医科大学中外交流协会成立于2010年，社团设有外联部、宣传部、策划部。

爱心支教协会

南京医科大学爱心支教协会成立于2012年，是一个以“因为生活，共同成长”为使命，以支教为中心的公益社团。在成立的短短三年里，成功开展了快乐周末社区行、为爱行走等公益活动，并于2015年召集全校师生成功举办了“公益背包—益行紫金山”爱心义卖等活动，一场负重登山公益体验行。

红丝带同伴协会

南京医科大学红丝带同伴协会成立于2004年，是江苏省首家防治艾滋病的同伴教育协会，十年来致力于推进青少年青春健康教育。因在此领域的特殊贡献，社团曾获得“江苏省十佳社团”、“全国优秀社团”、“南京医科大学第四届感动南医特别团队”等荣誉。

极真空手道社

南京医科大学极真空手道社成立于2005年，是松岛会馆南京支部下属大学道场之一，由总部专职教练前来学校授课，为南京医科大学江宁校区成立后创办的第一批社团。