合并前

仪董学堂

1902年，扬州第一所官立中学——仪董学堂创立，堂址东关街。

1906年，学堂改名为两淮中学堂。

扬州府中学堂

1908年，扬州府中学堂设立，堂址羊巷。

淮扬合一中学

1912年春，两淮中学堂与扬州府中学堂合并为淮扬合一中学校，校址羊巷。

1913年，按《江苏教育行政五年规划书》统一规定，改名为江苏省立第八中学校。

1924年，学校迁至府署。

尊古学堂

尊古学堂于光绪年间由梅花书院改名而来，堂址左卫街。

1908年，尊古学堂改为两淮师范学堂。

1912年，两淮师范学堂改称江苏省立第五师范学校。

合并后

1927年6月，江苏省立第八中学校和江苏省立第五师范学校合并，成立江苏省立扬州中学，学校分设一院、二院，一院在大汪边（高中部），二院在府署（初中部），乡村师范科在高邮市界首镇，另有实验小学4所。

1927年8月，江苏省试行大学区制，学校改隶大学，改名为第四中山大学区立扬州中学。

1928年2月，第四中山大学改称江苏大学，学校随之改名为江苏大学区立扬州中学。

1928年6月，江苏大学改称中央大学，学校改称中央大学区立扬州中学。

1929年9月，大学区制度废止，学校复名江苏省立扬州中学；至此，学校分高中部、初中部和乡村师范科，高中部除设立普通科和师范科外，又陆续添设土木工程科，机电工程科；且与上海同济大学合办德文班；又创建女子生活部；还附设高、初中预备班和德风中学。

1937年，日军侵华战争爆发，扬州沦陷，学校师生星散四方。

1938年，部分师生迁至泰州复校，称江苏省立扬州中学（泰校），校址在明德中学旧址；部分师生迁至上海复校称江苏省立扬州中学（沪校），校址南京东路慈淑大楼；部分师生迁至四川，成立国立四川临时中学，校址合川，后曾改名国立四川中学、国立第二中学。同年，江苏省立扬州中学（泰校）一部分迁至农村，校址小纪；另有一部分迁至上海，校址新市场、高乃依路等处。

1939年，迁至农村的泰校部分改名为江苏省立扬州中学苏北分校；迁至上海的泰校部分成为江苏省立扬州中学本部；江苏省立扬州中学（沪校）成为江苏省立扬州中学第二分院。

1940年，留在扬州的部分师生入羊巷，恢复江苏省立扬州中学，后改称苏北公立扬州中学。

1942年，江苏省立扬州中学本部被迫改名为树人补习社，江苏省立扬州中学第二分院被迫改名为慈淑补习馆。

1943年，江苏省立扬州中学苏北分校更名为江苏省立扬州中学，迁址坂抡、孙庄，后再迁塘头。

1945年9月，抗战胜利后，江苏省立扬州中学迁回扬州，苏北公立扬州中学并入，校址羊巷。

1946年，学校迁回大汪边原址，旧府署原址未能收回。

1949年5月，学校更名为苏皖边区二分区区立扬州中学；同月，学校再次更名为苏北扬州行政区区立扬州中学。

1951年1月，改名为苏北扬州中学。

1951年3月，扬州市中学（原县中）并入，工商科划出。

1952年，职业专科全部划出。

1953年9月，更名为江苏省扬州中学。

2006年，与富力地产集团联合创办江苏省扬州中学西区校（民办学校）。

2011年6月，该校2010级3班由教育部授牌命名为“吴大观班”。

2012年10月20日，举行建校110周年校庆庆祝大会，该校校友江泽民同志题词：“树人堂下教书育人桃李多芬芳，奋进路上建功立业中华更昌盛。”

2013年，江苏省扬州中学西区校停止招生。