根据上述职能，区公安分局设置20个内设机构（包括执法勤务机构、综合管理机构）。

（一）执法勤务机构设置

1、指挥中心，内设4个股：①秘书股、②指挥调度股（对外称“110报警服务台”，加挂“分局技术防范管理办公室”牌子）、③调研宣传股、④信息通信科技股。

2、法制大队（加挂“分局行政复议办公室”、“信访办公室”牌子）。

3、国内安全保卫大队内设3个中队。

4、刑事侦查大队，内设1个办公室和7个中队。中队是①一中队（人身侵害型犯罪侦查中队）、②二中队（黑社会犯罪侦查中队）、③三中队（情报图侦中队）、④四中队（刑事科学技术中队，加挂“广东省惠州市惠阳区公安司法鉴定中心”，增挂“分局刑事科学技术室”和“分局物证鉴定室”牌子，下设法医检验专业实验室、痕迹检验专业实验室、影像技术专业实验室）、⑤五中队（侵财型犯罪侦查中队）、⑥六中队（电信网络诈骗犯罪侦查中队）、⑦七中队（追逃协外中队）。

5、治安管理大队，内设1个办公室和7个中队。中队是①案件侦查中队、②特种行业管理中队、③危险物品管理中队、④基层基础指导中队、⑤保安与内管中队、⑥户政管理中队、⑦出入境管理中队。

6、交通警察大队，内设9个股（室、队）：①办公室、②违章处理办公室、③装财股、④宣传设施股、⑤交通事故处理中队、⑥机动巡逻中队、⑦侦查中队、⑧车管股、⑨女子中队；内设10个辖区中队：①城区一中队、②城区二中队、③平潭中队、④永湖中队、⑤新圩中队、⑥秋长中队、⑦沙田中队、⑧镇隆中队、⑨秋南中队、⑩三和中队。

7、经济犯罪侦查大队，内设1个办公室和4个中队。中队是①金融涉税罪案侦查中队、②商贸、合同罪案侦查中队、③侵犯知识产权、假币罪案侦查中队、④侵占、挪用款物罪案侦查中队。

8、巡逻警察大队，内设1个办公室和4个中队。中队是①机动巡逻中队、②淡水巡务中队、③秋长巡务中队、④秋南巡务中队。

9、特警大队，内设3个中队：①反恐防暴中队、②警卫中队、③机动中队。

10、网络安全保卫大队，内设1个办公室和3个中队。中队是①管理监察中队、②案件侦查中队、③互联网信息监控中队。

11、缉毒大队，内设1个办公室和2个中队。中队是①缉毒中队、②管理中队。

12、反恐大队。

13、便衣侦查大队。

14、情报信息大队。

15、打击走私大队。

16、食品药品与环境犯罪侦查大队。

17、森林警察大队，内设3个股：①政秘股、②法制股、③治安股（加挂“刑警队”牌子）。

（二）综合管理机构设置

1、政工室。

2、监督室。

3、警务保障室。