杭州律协的执行机构为秘书处，负责组织实施律师代表大会、理事会、常务理事会、会长办公会议的各项决议、决定，承担律协的日常工作。秘书长为刘国健（兼任），副秘书长为沈海鸥、李美华、余素珍。杭州律协秘书处下设办公室、业务部、会员部、纪律部四个工作部门。

办公室：负责秘书处的人事、财务、文秘、信息资料、宣传联络、日常后勤保障等非其它部门职责的工作，协会综合事务、会议的组织和协调。对应资产管理与财务委员会，宣传与对外联络委员会，青年律师工作委员会，律协党委、团委，大学生见习训练基地工作。

业务部：负责专业委员会工作组织、协调，律师继续教育、实务理论研讨工作，组织开展中小所、区县（市）所工作，组织行业发展研究和规则制定。对应律师业务指导委员会，教育培训委员会，公益活动工作委员会，区县（市）律师工作委员会，中小律师事务所工作委员会，律师行业发展与规则委员会工作。

会员部：负责组织会员之间交流、文体福利及会员奖励，申请律师执业人员管理考核。对应会员管理与文体福利（律师文化建设工作委员会），实习考核委员会，女律师工作委员会，未成年人保护工作委员会，杭州律师艺术团。

纪律部：负责投诉、执业纠纷的受理、调查和调解等日常事务；律师职业道德和执业纪律教育与律师执业日常监管等工作。对应纪律与惩戒工作委员会，参政议政工作委员会，维护律师执业合法权益委员会，重大敏感案件指导委员会。