建校二十多年来，在历届校领导班子和广大师生的共同努力下，学校立足甘南，面向基层，服务藏区，因地制宜，办出了地方特色，培养了地方人才。在办学过程中解放思想，实事求是，积极开拓办学新思路，不仅注重教学质量的提高，同时又从州情地情出发，在医学基础课方面增加高原生理、病理及自然疫源性疾病的课程，在临床课方面以常见病、多发病、地方病为主，注重实效性，培养实用型。在圆满完成国家统配招生任务的同时，实行定向招生，定向分配，先后开设边远地区班、藏医僧侣班、世行贷款技护班、藏医护理班等专业班级，为社会广开就学门路和职业教育渠道，实现了为甘南边远民族地区培养“分得下、留得住、用得上”的实用医务人员的目标，充实了基层医疗卫生战线，完成了全州范围的防病治病和计生计免等工作。

二十多年来，甘南藏族自治州卫生学校共培养大中专生2700多名，在校生仍达600名。二千多名毕业生绝大多数工作在甘南州广大农牧区的基层医疗单位，分布在全州142个医疗卫生机构和361个农村医疗网点上，占全州现有卫技人员的近90%，成为自治州基层医疗卫生战线上的主力军，很大一部分已成为当地医疗战线的骨干和中坚力量；还有相当一部分被分配到张掖、武威、陇南等藏族聚居区。极大地充实了基层医疗卫生队伍，为改善农牧区医疗卫生状况作出了贡献，取得了良好的社会效益。藏医作为青藏高原一枝独特的医药奇葩，世代为藏族人民和兄弟民族群众所接受和喜爱。为挖掘和弘扬优秀的藏医药文化，培养更多的藏医人才，为农牧区群众服务，甘南藏族自治州卫生学校自成立以来，就立足甘南，从甘南州实际出发，开办了藏医士专业，先后培养了310名中等专业学历的藏医士，为甘南和武威地区的藏医药事业发展作出了一定贡献。不仅为继承和发展藏医药事业，解决藏医药后继乏人问题开辟了道路，同时，也为藏医学教育步入现代教育体系摸索了一条路子。