广东中医药博物馆大楼1楼架空；2楼设临展展厅、办公区、服务区等；3楼设中国医学史展厅、广东中医药发展成就展厅、岭南医学展厅等；4楼设中药展厅、中成药展厅、岭南药材模拟生态区等；5楼设针灸养生展厅、科普园地、校史展厅及储藏室等。广东中医药博物馆

基本陈列

《中国医药史展》：以中国医药发展史为线索、医史文物展览为主题，展示馆藏医史文物和文献，分为医药创始、体系形成、晋唐医学、宋金元医学、明清医学、近代医学、现代中医药七大部分。

《中药标本展》：分前言、中药历史展区、中药来源展区、中药采集展区、中药炮制及饮片展区、中药流通展区、中药使用展区、中药养护展区、中药资源保护展区、中药人文展区等。

专题陈列

《广东中医药发展成就展》：广东中医药采中原之精粹，纳四海之新风，深深扎根于广大人民群众之中，在广东省的政治、经济和文化生活中具有非常重要的地位。广东省委省政府审时度势，提出广东要在中医药大省的基础上进一步建设成为中医药强省，并且出台了系列重要的政策文件，推动中医药强省建设工作的进行。

《广州中医药大学校史展》：2006年广州中医药大学50周年校庆之际举办该展览，分为大事记、今日写照、历任领导、历史回眸、领导关怀、名医名师、前身回溯、桃李芬芳、校史旧影、院所风采等篇章，从不同侧面展示了广州中医药大学的历史与成果。

医史馆

广东中医药博物馆医史馆以中国医药发展史为线索、医史文物展览为主题，展示原始社会至现代的医史文物和文献2000余件，分为医药创始、体系形成、晋唐医学、宋金元医学、明清医学、近代医学、现代中医药以及岭南医学发展八大部分，展现中医药学发展历史轨迹和岭南医学的独特成就。

在广东中医药博物馆医史馆内，独家馆藏医史文物有清代王晋绘《名医叶天士遗像》、现存最早刻有“疾”字字样的甲骨片、洛阳龙门石窟药方洞明拓片、清代十二时辰药瓶与十二生肖药瓶等。广东中医药博物馆

中药馆

广东中医药博物馆中药馆主要展出常用中药、道地药材、珍稀中药、岭南中草药、海洋药及常用中药剂型等标本2000余件，介绍药材真伪鉴别、中药防病治病等应用知识和中药的历史文化。馆藏的珍稀中药标本有特大野生人参浸制标本、鹿茸标本、百年油桂等。中药馆是华南地区最大的中药标本中心。