（一）办公室。负责机关日常运转工作。承担文电、会务、信息化建设、综治、保密、信访、机要、档案、政务公开、新闻宣传等工作。

（二）计划科（交通战备办公室）。参与编制全市综合交通运输体系规划，承担综合交通运输体系规划统筹衔接工作，编制、上报和下达公路、港口、站场等项目建设的年度计划并监督实施。负责交通工程建设项目前期工作的审核、上报。承担交通战备相关工作。

（三）安全监督科（应急办公室）。拟订全市公路、水路安全生产政策和应急预案并监督实施；负责有关安全生产和应急责任体系建设及管理工作。负责有关市级公路、水运工程安全监管工作。指导水、陆交通运输企业安全生产，开展“双随机、一公开”安全生产监督检查。会同有关部门处理交通重大伤亡事故，承办水、陆交通运输事故的综合统计分析，负责道路水路运输突发事件应急值守和信息报送工作。

（四）人事教育科。负责机关和所属单位的机构编制、组织人事、干部教育、劳动工资、技术职称、年度考核、人事档案、统计、离退休干部管理等工作。指导全市公路、水路行业人才队伍建设。指导交通运输行业协会工作。

（五）财务审计科。负责市级交通运输系统财务管理及资金使用监管，制订机关财务内部管理制度并监督实施。负责市级交通运输部门预决算、专项资金的预决算及绩效评价。承担交通国有资产管理、政府采购工作。

（六）法规与审批服务科。负责本部门有关规范性文件的合法性审查工作。指导交通运输系统法治建设、普法教育和行政执法监督工作。承担交通体制改革工作。统筹协调“放管服”改革工作。承担行政复议、行政应诉等工作。负责组织协调行政审批事项的勘察、论证、审核、上报等相关工作。负责行政审批工作的组织、协调、办理和督办。牵头负责交通运输行业信用体系建设工作。

（七）工程管理科。负责拟定全市交通建设、工程质量相关制度和技术标准并监督实施。负责交通建设从业资质和信用评价管理工作。监管交通建设工程公共资源交易活动，按规定负责交通工程建设项目的设计文件审查、施工许可、竣工验收工作。

（八）公路管理科。拟定公路建设、养护、路政、运营相关政策、制度和技术标准并监督实施。组织协调国省干线公路工程建设和工程质量、安全生产监督管理。组织国省干线公路基础设施的养护、管理。指导农村公路建设工作。

（九）道路运输管理科。承担全市道路旅客运输、货物运输以及运输服务保障等行业管理。督促指导城市公共交通、出租车和网约车的行业管理。按规定组织协调重点物资和紧急客货运输。负责道路运输和车辆的技术标准管理和监督。承担交通运输运量分析统计工作。督促指导道路运输行业质量信誉考核和服务管理工作。督促指导交通运输行业节能减排和环保工作。协调交通物流行业管理工作。

（十）港航海事管理科。负责拟定水路工程建设维护、航政、港政、运政、船检相关政策、制度和技术标准并监督实施。组织协调水路工程建设和工程质量、安全生产监督管理工作。组织水路基础设施的维护、管理工作。组织协调长江生态大保护的相关工作。

机关党委。负责机关和所属单位的党群工作。