办公室（政策法规科）

规划基建科

水利管理科（水土保持科）

水资源科（全市节约用水管理办公室）

财务科

人事教育科

机关党委

河道管理处(河道采砂管理处)

市机电排灌工程管理站

市水旱灾害防御处

市河长制工作处

市村镇供水管理处

市水利建设管理处

市水政监察支队

市城市防洪管理处

市防汛抗旱物资储运站