2003年，海沧区政府与北京师范大学联合创办北京师范大学厦门海沧附属学校，校址位于海沧区嵩屿中路1号（现未来海岸校区）。

2014年9月，学校京口校区投入使用。

2015年9月，学校体育中心校区投入使用。

2021年，学校推进集团化办学。

2021年8月，学校嵩屿校区投入使用。

2021年11月，学校思齐校区投入使用。

2021年底，北附与北师大转为教育资源深度合作，北京师范大学厦门海沧附属学校更名为厦门市海沧区北附学校，成为厦门市海沧区第一个公办学校教育集团。

2022年6月，厦门市海沧区北附学校更名为厦门市海沧区北附学校教育集团未来海岸小学，并在体育中心校区基础上新设厦门市海沧区北附学校教育集团体育中心小学，在京口校区基础上新设厦门市海沧区北附学校教育集团京口中学，在思齐校区基础上新设厦门市海沧区北附学校教育集团思齐中学。

2024年2月，厦门市海沧区北附学校教育集团未来海岸小学和厦门市海沧区北附学校教育集团京口中学合并为厦门市海沧区北附学校，厦门市海沧区北附学校教育集团体育中心小学更名为厦门市海沧区北附学校体育中心分校，厦门市海沧区北附学校教育集团思齐中学更名为厦门市海沧区北附学校思齐分校。厦门市海沧区北附学校教育集团为公立全日制学校集团，所属学校均为政府事业单位，隶属于福建省厦门市海沧区教育局。