农业机械系

1958年，鲁卓、徐长康等同志筹备建设农业机械系。

1959年，经安徽省委正式批准成立安徽农学院农业机械系，设置“农业机械化专业”，当年招生90名。

1960年9月，农业机械系增设“农业机械制造专业”、 “农业电气化专业”，并招生。

1961年9月，农业机械系与安徽农机专科学校、安徽水电学院合并，成立安徽农业机械学院，“农业电气化专业”并入电力系，“农业机械制造专业”并入“农业机械化专业”。

1962年7月，安徽农业机械学院撤消，农业机械系重新回归安徽农学院。

1965年8月，根据安徽省人民政府决定：农业机械系停办，66届毕业生提前于1965年毕业。

1970年9月，农业机械系恢复并重新招生，当年10月19日首届工农兵学员入学。按照文化大革命当时建制，农业机械系名称为“农业机械化专业连队”。

1970年初，筹建安徽农学院农业机械修造厂，当年12月29日试制成功第一台农用深井水泵。

1973年，“农业机械化专业连队”重新更名为“农业机械系”，招收“农业机械修造专业”学员。

1980年，“农业机械修造专业”更名为“农业机械化专业”。

1985年，开始招收“农产品加工专业”成人专科，1986年正式成立专业招生。

农业工程系

1989年11月，农业机械系更名为农业工程系。同年建立“农用机电专科专业”并招生。

1992，成人教育专科计算机及其应用专业开始招生。

1993年，在“农业机械化专业”内设置“汽车与拖拉机”、“机械电子工程”专门化方向。

1995年9月，建立“汽车与拖拉机专业”，并招生。

1996年，建立“农业建筑与环境工程”专科专业，并招生。建立“农业机械化第二学士学位专业”，并招生。

1998年，经国务院学位委员会批准，建立“农业机械化工程”硕士学位授权点，于1999年开始招收硕士研究生。

工学院

2001年12月，农业工程系更名为工学院。“农业水利工程专业”批准建立。

2002年，“电子信息工程”批准建立，并于2003年开始招生。

2003年，学校批准工学院"机械加工训练中心“3200m立项建设；学校拨款174万元进行实验室设备更新，重点建设"计算机工程绘图”、“电工电子技术”、“力学与机械学”实验室；“机械设计与理论”硕士学位授权点批准建立。

2004年，工学院教职工集资50万元，投入“机械加工训练中心——机电工程园”建设。

2005年，3400m“机械加工训练中心——机电工程园”建成并投入金工教学实习使用；“车辆工程”硕士学位授权点批准建立。

2006年，“车辆工程”本科专业批准建立并于次年招生。

2010年，“安徽省农业工程学”会恢复成立，工学院当选为理事长单位。

2011年，“农业工程”和“机械工程”一级学科获批，并于2012年开始招生；同年，成为“农业部南方农业装备科学观测实验站”依托单位并挂牌。