1956年，原重庆建筑工程学院卫生工程系创建。

1979年，更名为城市建设工程系。

1994年，更名为城市建设学院。

2011年，环境与生态工程专业获批一级学科博士点。

2014年，环境与生态工程专业获批博士后流动站，“三峡工程生态与环境监测系统重点站-御临河站”项目顺利通过国务院三峡办验收。

2019年，重庆大学整合原城市建设与环境工程学院和原资源及环境科学学院的环境科学与工程、生态学、市政工程学科资源，组建重庆大学环境与生态学院。

2020年，学院环境生态工程专业入选国家级一流本科专业建设点。