浙江省立农业技术学校时期

农校创办于1950年9月，定名浙江省立宁波农业技术学校，原址设在奉化溪口武岭学校。龙学潮任学校负责人，招棉、麻、农作物三个专业班。1953年9月改名浙江奉化农业学校，朱之光兼任校长。

宁波农学院时期

1960年暑期，农业专科学校与宁波农科所、宁波农具研究所合并为宁波农学院。周效儒兼任校长。1961年6月，改办宁波地区农业专科学校。同年8月，大专停办，撤销溪口分部，改办宁波农校。1964年9月，与宁波农科所，宁波农机所和宁波农场一起，以四合一形式，办半农半读的中等农业技术学校。

浙江万里职业技术学院时期

浙江万里学院时期

2002年1月9日，全国高校设置评议委员会三届五次会议评议，浙江万里学院正式成为本科院校。2003年宁波机械工业学院并入。次年，与英国诺丁汉大学联合创办了全国第一所中外合作大学——宁波诺丁汉大学。2005年，以优良成绩通过教育部本科教学工作水平评估。至2011年，学校被国务院学位委员会批准为硕士专业学位研究生教育试点单位，并成为试点单位联盟理事长单位。2015年，成为“浙江省应用型建设试点示范学校”。

2016年，浙江省物价局、浙江省教育厅同意浙江万里学院作为民办高校扩大收费自主权的试点学校，根据实际教育成本自主制定学费标准。次年，学校成为“全国深化创新创业教育改革示范高校”。2018年，在德国汉堡设立浙江万里学院海外校区。2021年，浙江万里学院成为硕士学位授予单位。

2023年3月14日，由浙江万里学院、中国海洋大学、宁海县人民政府三方共建的浙江万里学院宁海海洋生物种业研究院正式开园。4月13日上午，宁波市行政合法性审查服务研究中心在浙江万里学院挂牌成立。4月13日上午，宁波市行政合法性审查服务研究中心在浙江万里学院挂牌成立。

2024年9月25日上午，浙江万里学院美术馆正式开馆。“江山如此多娇——庆祝中华人民共和国成立75周年”美术书法作品展作为美术馆首展，吸引了众多师生前来参观。