浙江省医院协会设立五个委员会（组织外联委员会、医院质量安全管理委员会、医院文化委员会、财务监管委员会、自律维权委员会），办事机构设有协会办公室、研究室（卫生部医院管理研究所医院可持续发展研究室）、培训服务部、评估服务部。已成立六个分支机构(《临床检验管理专业委员会》、《药事管理专业委员会》、《民营医院管理分会》、《精神病医院管理分会》、《病历质量管理专业委员会》、《医院行政管理专业委员会》)。现有团体会员单位235家，个人会员1000余人。

协会认真履行职能，坚持全心全意为会员服务的宗旨。成立以来，每年举办医院管理论坛，召开学术年会。每两年举办一次“海峡两岸医院管理论坛”；举办“医院社会责任论坛”、“医院危机管理和突发事件应对论坛”、“医院可持续发展研讨会”、“公立医院改革与医院可持续发展院长论坛”等，针对当前和今后一个时期医疗卫生改革和医院管理的热点和难点问题，展开研讨、交流经验。

协会积极开展医院管理软科学研究，协会2004年开始设立《浙江省康恩贝医院管理软科学研究项目》；2009年开始设立《浙江省医院可持续发展扬子江研究基金项目》。2009年设立《浙江省医院管理豪森培训项目》，开展医院管理人员的岗位培训和继续医学教育，促进医院健康发展；认真做好《医院管理信息》半月刊和《现代医政与管理》会员内部季刊的编辑出版，为促进全省医院的改革发展，提高管理队伍素质和科学管理水平，努力发挥着应有的作用。协会将进一步解放思想，更新观念，振奋精神，求实奋进，努力办成医院管理者之家，为医院的现代化建设做出新的贡献。