协会目前下设10个分支机构：科普工作委员会、健康服务工作委员会、新闻宣传工作委员会、青年工作委员会、化妆品分会、消毒分会、营养食品分会、健康用品分会、电商分会、原料与包材分会等。此外，承担了浙江省消毒标准化技术委员会、浙江省营养学会老年营养专委会、杭州市中医健康养生行业协会等秘书处工作。

浙江省健康产品化妆品行业协会是在浙江省经济和信息化委员会、浙江省民政厅的业务指导和监督管理下，遵守国家宪法、法律、法规和国家政策，以双向服务为宗旨，向政府反映企业的愿望和要求，向企业贯彻传达政府关于本行业的方针、政策；结合本省实际，为行业、企业和社会做好服务，为政府决策当好参谋；在行业内进行自我协调、自我约束、自我管理、自我完善；引导企业以市场为导向，以科技为动力，走产业化、规模化发展道路，促进我省保健食品产业的健康、快速发展，保护消费者的合法权益。

协会自成立以来，致力于浙江省健康美丽行业可持续发展，在行业政策法规、人才赋能、资源整合、产业上下游协同发展等方面做了大量的工作。