本馆位于浙江大学紫金港校区西南端，是校内外接壤的区域。其东侧与北侧，面朝浙大校园；西侧与南侧，分别为花蒋路与杭州市观光运河余杭塘河。这一地理位置，使本馆在服务校内师生的同时，也便于校外公众分享其资源。

结构与风格：本馆主体由三个横向（东西）的条状结构组成，三者又由若干纵向（南北）的廊道结为一体，从而构成一类似手卷之隔水、画心、与尾跋的三段式结构。设计的原则侧重博物馆的功能需求，不炫奇立异；风格简约、平实、有现代气息。功能分区：本馆占地50亩，建筑面积2·5万平方米。除地下车库外，全馆分为两个功能区，即博物馆区与学术区。

博物馆区分布于第一层；包括四个功能不同大小有别的展厅、藏品库房、修复工作室与学术报告厅等，是博物馆开展收藏、展览与教育项目的场所；此外又设有书店、礼品店与咖啡厅等，为参观者提供所需服务。

学术区分布于第二层至第四层，由艺术与考古专业图书馆、不同功能的艺术史专业教室、学者与职员办公室构成。不同于普通的公立博物馆，本馆是由博物馆、图书馆及教学研究空间构成的一综合设施。

展厅与文保标准：本馆展览空间共3500平方米，可同时举办三至四个大型展览，或六至九个小型专题展览。为满足国际借展的需要，本馆的文保标准，由国际文保专家负责设计，可符合国际最严格的文物保护标准。