2003年4月，浙江大学海洋科学与工程研究中心成立。

2009年5月，海洋研究中心、海洋科学与工程学系先后成立。

2012年4月，海洋学院筹建领导小组成立。12月，海洋学院（筹）成立，舟山校区开始动工。

2013年7月，正式成立海洋学院。

2015年8月，舟山校区投入使用。9月，海洋学院整体迁入舟山校区，国家海洋局与浙江大学签约共建浙大海洋研究院。

2023年5月20日，浙江大学海洋学院发展委员会在舟山校区成立。