浙江大学附属中学的前身是丰子恺、潘天寿等明远学社成员创办于1947年的杭州私立明远中学。

1949年春，由于时局动荡处于政局变革之际，学校已无法进行教学工作，只能宣布暂时停课解散。5月杭州解放，6月在市区吉祥巷原省教育会（另有史料记载：白莲花寺）暂租赁民房数间复课。8月斐章女中并入杭州私立明远中学，9月迁至西湖卧龙桥郭庄。

1956年6月，学校由私立转为公立，隶属于杭州市教育局。初夏学校搬入松岳路（既现校址：曙光路89号），学校正式更名为杭州市第一初级中学。

1959年1月，学校隶属于浙江大学，更名为浙江大学附属中学，开始招收高中新生，成为完全高中。

1972年1月，学校划归杭州市教育局领导，并改名为浙江省杭州第十五中学。

1992年2月，学校恢复浙江大学附属中学的校名，并创办东方中学（民办）。

1996年， “求是中学”并入浙江大学附属中学，6月设立浙江大学附属中学初中部，同年并评为浙江省一级重点中学。

2000年4月，浙江大学附属中学隶属于杭州市教育局，同年学校初中部独立，学校成为一所完全高中。