2018年5月28日，入选中共福建省委文明办“第十三届福建省文明单位”候选名单，并向社会公示，接受群众监督。

2020年11月20日，入选“第六届全国文明单位”名单。

2020年11月，被授予“福建省抗击新冠肺炎疫情先进集体”荣誉称号。

2021年5月，福建省人民政府办公厅农业处获得福建省脱贫攻坚先进集体荣誉称号。

2022年4月，福建省人民政府办公厅机关党委被通报表扬为福建省直机关五一先锋号集体。

2022年8月20日，福建省人民政府办公厅农业处被福建省委和省政府授予“福建省造林绿化工作先进集体”称号。