学校初创

昭通学院历史可追溯到1906年清政府创设的师范传习所，历经省立第二师范学校、昭通地区师范学校，1978年成立昭通师范专科学校，是“文革”结束后全国首批确定，云南省州、市建校较早的高校之一。

1993年，学校定名为昭通师范高等专科学校，简称昭通师专。

升格本科

2012年3月，经教育部批准，学校升格为本科院校，定名为昭通学院。

2013年6月28日，昭通学院正式揭牌成立，成为昭通市第一所本科层次的普通高校。

2021年12月30日，云南省院士专家工作站管理委员会下发的《云南省院士专家工作站管理委员会关于批准认定2021年云南省院士专家工作站的通知》，批准认定学校刘鸿高副校长领衔申报的“戴玉成专家工作站”为云南省院士专家工作站，这是学校获批建设的首个省级院士专家工作站。

2022年，学校被列入教育部师范教育协同提质计划重点支持院校。

2023年，学校成为云南省教育厅和昭通市人民政府共建高校。