1951年，章丘县文物管理工作由县文化馆一名专职文物干部负责。

1981年，成立文物组，隶属文化馆。

1984年9月27日，在文物组的基础上组建起博物馆，地址在章丘县明水汇泉路西首现文化馆院内。

1990年7月，博物馆移至清照路135号的李家大院。李家大院距今约有120多年的历史。多年来经数次维修，基本保持建筑原貌。建国后土地改革时，李家大院的前院和后院归政府所有，中间东西厢房归原主所有。此后李家大院一直作为县委宿舍使用。

1990年，章丘县博物馆搬入才正式划归章丘县博物馆所有。

1994年5月30日，根据文物工作的需要，经章丘市人民政府批准，章丘市文物保护管理所成立，与章丘市博物馆合署办公。

2016年元旦，济南市章丘区博物馆新馆正式启用。