学校前身

山东省立商业专门学校

1948年，中共华东局委员兼财委主任曾山指示陈先（时任华东财经办事处会计队队长、军管会会计处处长）尽快创办山东省立商业专门学校，校长由时任山东省财政厅厅长顾准兼任，陈先任副校长并主持日常校务工作。10月5日，在济南市委机关报《新民主报》刊登招生简章。这标志着一所“抗大”式高等学府——山东省立商业专门学校开始创立。

山东经济学院

山东经济学院的前身是山东财经学院，创建于1952年，由山东会计专科学校与齐鲁大学的经济系合并组建而成，是山东省建校最早的财经类普通高校，也是全国建校最早的财经类普通高校之一。1953年夏，全国高等学校大调整，山东财经学院并入上海财经学院，部分教职员工并入上海财经学院，部分教职员工分配到山东省财贸系统各干部学校和其他高等院校。

1958年，经中共山东省委批准，在原山东省商业、合作、粮食、财政、银行等五个专业干部学校的基础上，成立了山东财经学院。1970年，按上级要求，学校停办，多数教职员工分配去建设菏泽和北镇师专。1971年，在原山东财经学院的基础上，筹建了山东财贸干校，承担全省财贸系统的干部培训工作。1978年，经国务院批准，原山东财经学院恢复办学，并更名为山东经济学院。1993年获得硕士学位授予权。

山东财政学院

合并发展

　2009年6月，山东省对新增博士、硕士学位授予单位立项建设规划进行公示，明确“山东财经大学(暂定)立项建设博士学位授予单位”，这是官方文件首次公开出现“山东财经大学”提法。

2011年4月，教育部致函山东省政府，同意山东经济学院与山东财政学院合并筹建山东财经大学，筹建期限为1年。6月29日，山东省人民政府下发关于组建山东财经大学（筹）的通知，撤销山东经济学院和山东财政学院的建制，山东经济学院与山东财政学院正式合并组建为山东财经大学（筹）。12月，学校接受了全国高校设置评议委员会专家组对该校筹建工作的全面评估。

2012年1月13日，教育部在沈阳召开全国高校设置评议专家委员会会议，在评审过程中，山东财经大学以高票顺利通过去“筹”。8月23日，财政部、教育部和山东省人民政府签署协议，共同建设山东财经大学。8月30日，山东财经大学成为在中央财经大学揭牌成立的“中国财政发展2011协同创新中心”理事单位。

2013年1月25日，由山东省学位委员会组织的专家组对山东财经大学博士学位授予单位立项建设情况进行整体验收。3月2日，山东财经大学成为在上海财经大学揭牌成立的“会计改革与发展协同创新中心”理事单位。7月，经国务院学位委员会批准，学校取得博士学位授予权。12月，学校入选山东省“省部共建人才培养特色名校立项建设单位”。

2016年4月20日，学校将圣井校区提升为主校区。2020年，学校成为山东省高水平大学建设高校。

2020年4月，山东财经大学中日韩研究院获批“山东省外事研究与发展智库”，认定机构为山东省政府外事办公室。8月，学校加入中俄（山东）教育国际合作联盟。11月，山东财经大学中日韩研究院揭牌成立。

2021年1月，加入中国自由贸易试验区研究院联盟。6月，山东财经大学文化和旅游产业学院正式成立。同月，入选山东省智慧教育示范校创建单位名单。

2021年，学校获省属本科高校分类考核“优秀”等次。2022年6月，学校组建公共管理与法学学部。同年12月，学校的山东财经大学信息学部成立，山东财经大学区域与国别研究院成立。

2024年11月27日上午，山东财经大学案例中心成立大会暨产学研案例建设研讨会在燕山校区成功举办。

2025年7月，山东财经大学成立人文经济学研究院。