1949年12月，中南军政委员会教育部的指令，进驻广西的中国人民解放军军管会成立文教接管部。

1950年4月，成立广西省文化教育厅。随着全省政治、经济、文化教育形势的逐步发展，省人民政府决定分设文化、教育工作机构，11月成立广西省教育厅。

1958年3月，广西省改为广西壮族自治区，省教育厅随之改为广西壮族自治区教育厅。

1968年3月成立自治区教育厅革命领导小组。

1968年8月至1969年11月，广西壮族自治区革命委员会内设政治工作组，政治工作组下设文教小组，统管全区文化教育工作。1969年11月，根据自治区革命委员会的决定，原文教小组分设文化小组、教育小组。

1971年4月，自治区革命委员会教育小组改为自治区革命委员会教育局。

1979年12月，自治区革命委员会改为自治区人民政府，自治区革命委员会教育局随之改为自治区教育局。

1983年9月，自治区教育局改为自治区教育厅。

1988年6月，自治区教育厅改为自治区教育委员会。

1998年4月14日，自治区机构编制委员会在《关于自治区人民政府部分委厅机构调整和更名的通知》（桂编〔1998〕33号）中明确：“自治区人民政府对应国务院组成部委的部分委厅作相应调整和更名”，“自治区教育委员会更名为自治区教育厅。”

2000年6月27日，自治区党委办公厅、自治区人民政府办公厅印发《中共广西壮族自治区高等学校工作委员会广西壮族自治区教育厅职能配置、内设机构人员编制规定》的通知（桂办发〔2000〕40号），规定：广西壮族自治区教育委员会更名为广西壮族自治区教育厅（以下简称自治区教育厅），中共广西壮族自治区高等学校工作委员会（以下简称自治区高校工委）是中共广西壮族自治区委员会派出机构，与自治区教育厅合署办公，实行一个机构，两块牌子。