中国建筑第二工程局有限公司前身是中国人民解放军华东野战军步兵第99师， 组建于1952年，是国家“一五”时期156项重点工程建设的骨干队伍。从1953年建设长春中国第一汽车制造厂开始，后转战大江南北，陆续承建了第一、第二重机厂等一大批国家重点工程和国防尖端工程，参加了唐山震后恢复建设，为国家基本建设作出了突出的贡献，被原建工部授予“工业建设的先锋，南征北战的铁军”光荣称号。改革开放初期参加了深圳、汕头、厦门、海南等特区基本建设，在深圳地王大厦创造了两天半一层楼的“深圳速度”。随着改革开放的不断深入，中国建筑第二工程局有限公司积极适应市场经济发展新形势，调整经营战略，率先进入市场求发展，现已形成华东、华北、华南及中原四大片区的市场布局，经营触角延至四川、重庆、陕西、甘肃等西部地区市场，施工项目遍及全国19省、直辖市、自治区。同时积极实施国际化经营战略，先后在伊拉克、约旦、阿联酋、博茨瓦纳、越南、文莱、阿尔及利亚等地开拓了海外施工任务。

2007年中国建筑第二工程局有限公司及其下属机构根据中国建筑工程总公司整体改制上市的要求全部改制为“一人制”有限公司后组建而成。

2023年5月16日，中国建筑第二工程局有限公司2023年面向专业投资者公开发行科技创新可续期公司债券项目状态更新为已反馈。

2025年3月27日，中建二局与珠海华发集团在珠海签署战略合作协议。