盐田区人民医院（集团）学科按三级甲等医院架构设置完整，设有一级学科28个、二级学科40个，其中，中西医结合心血管内科为市中医特色专科，骨科、普外科、甲乳外科、中西医结合泌尿外科、中西医结合肛肠病特色专科、神经内科、内分泌科、口腔科、麻醉科、检验科、放射科、重症医学科等为区级重点学科。是首批深圳市急性心肌梗塞医疗救治定点医院和深圳东部唯一认定急性脑血管定点救治单位，建成国家级标准版胸痛中心。

2014年起，医院（集团）与中南大学湘雅医院正式签订战略合作协议，湘雅医院专家长期进驻该院，开展手术指导、门诊、会诊、授课等。2016年医院挂牌成为湖南中医药大学教学医院。2017年，医院（集团）柔性引进国内著名心血管病专家胡大一教授心血管诊疗及康复团队，建成深圳市最大心脏康复中心，极大提升该院心血管疾病救治能力，为建设深圳市领军心血管康复治疗中心奠定坚实基础。2020年，按照市卫健委统一安排，与深圳市人民医院建立医联体合作关系。此外，医院（集团）还与深圳东部各家公立医院签署合作协议。2020年，邀请多名省级、市级名(优)中医进驻名中医馆，为辖区百姓提供高质量中医药服务。