2006年9月5日，厦门钨业国家级研发中心奠基仪式在厦门湖里区五缘湾举行，中心将建成全国一流、国际先进的研发基地和高新技术产业化示范基地，被列为厦门市重大项目，获1000万元政府资金资助，并且通过了国家级工程技术中心可行性论证。

2006年8月9日，虹波公司与日本联合材料株式会社共同投资建设的成都联虹钼业有限公司举行开工典礼，正式推出中国产的高品质钼板和钼制品；8月28日，虹钼公司3000吨钼酸铵工程竣工并投入试生产，解决了因钼制品原材料制约集团公司发展的瓶颈问题，为厦钨集团进军钼金属材料上游产品奠定了基础。

2006年8月1日，金鹭公司引进的微软axapta系统经过半年多的实施成功上线，提高了公司的信息化管理水平和竞争力，为厦钨集团今后实施erp提供了可借鉴的范例。

2006年7月，豫鹭公司日处理10000吨低品位白钨回收项目改造完成，使豫鹭日处理矿石的能力增加到15000吨，成为国内最大的低品位白钨回收生产线，为提高厦钨的原料自给率提供了保障。

2006年7月，公司制定新的五年（2006年--2010年）发展规划，确立了以钨产品为主业，通过“t”型产品开发策略，重点发展硬质合金、丝材及后延产品、贮能材料，快速扩大钼产品，选择风险小、收益高的房地产项目进行开发的企业发展战略。

2006年3月7日，厦门钨业举行股权分置改革相关股东大会，公司每10股送2·9股的股改方案以全体股东99·82%的赞成率及流通股股东99·08%的赞成率获得通过，顺利完成了股权分置改革，使公司股票的价格与所有股东的利益相关，形成了全体股东共同的利益驱动机制，公司法人治理结构进一步完善，为引入股票期权激励机制、再融资等有利于公司发展的金融创新工具奠定了制度基础。

2005年12月，海沧分公司新征200亩土地用于发展新能源材料；虹波公司从美国哈泊公司引进的钼转炉开始安装调试，“电真空电光源钨钼材料”获得四川省名牌产品；虹广公司搬迁可行性报告通过青浦工业区入户审核，φ0·5╳1000磨光钨杆开发成功；虹鹭公司“超重粗钨丝的规模化生产研究”被列入2005年国家863计划引导项目；金鹭公司被评为2005年度“厦门技术进步先进企业”。

2015年5月，国土资源部发布通知，中国五矿集团公司、中国铝业公司、包头钢铁(集团)有限责任公司、厦门钨业股份有限公司、赣州稀土集团有限公司、广东省稀土产业集团有限公司6家稀土集团整合重组方案已经有关部门批准备案。

2021年，厦门钨业公告，公司拟出资30，100万元收购关联方神威矿冶持有的博白巨典100%股权。

2022年8月25日，厦门钨业公告，2022年上半年营收241·58亿元，同比增长69·85%；归母净利润9·08亿元，同比增长32·08%。

2023年4月21日，厦门钨业公告，2022年，公司实现营业收入482·23亿元，同比增长51·4%；归母净利润14·46亿元，同比增长22·68%；基本每股收益1·0285元；公司拟每10股派发红利3·5元（含税）。本期钨钼、稀土和新能源主要产品量价齐升。

2022年公司钨钼业务整体向好，主要深加工产品销量继续增长，钨钼等有色金属业务实现营业收入131·6亿元，同比增长20·09%；实现利润总额14·51亿元，同比增长3·69%，若剔除公司联营企业投资收益的影响，公司钨钼业务利润同比增长14·02%。

公司同日披露一季报，2023年一季度实现营业收入85·62亿元，同比下滑18·51%；归母净利润4·4亿元，同比增长16·05%；基本每股收益0·3119元。本期公司能源新材料业务受终端需求下降影响，销售收入同比下降。

2023年8月，厦门钨业(600549·sh)定增申请获得上海证券交易所受理。