1950年，新疆省人民政府干部培训班成立。

1959年，升格为新疆财经学院。

1962年，转制为新疆财贸学校。

1980年，经国务院批准恢复新疆财经学院建制。

1998年，获批硕士学位授予权。

2000年，新疆财经学院与新疆经济管理干部学院和新疆财政税务学校合并组建新的新疆财经学院。

2001年，首先获得新疆mba办学权

2007年，经教育部批准，更名为新疆财经大学。

2012年，获批“中国（新疆）——中亚经贸合作服务国家特殊需求博士人才培养项目”。

2018年，获批博士学位授予单位。

2021年9月，入选第二批国家语言文字推广基地拟入选单位名单。

2022年5月，发起成立新疆新文科教育联盟并担任理事长单位

2025年4月11日，新疆财经大学机关运行保障研究中心揭牌成立。

2025年5月29日，新疆财经大学数智供应链产业学院揭牌仪式举行。