截至2024年公开信息，机构内设5个科室：

办公室：负责行政事务协调与文电处理

财务科：承担医保基金收支核算与预决算编制

医疗管理科：监督定点机构服务行为

待遇审核科：负责参保人员待遇资格认定

稽核科：开展医保基金使用稽查

现有人员编制19名，配备主任1名（副处级）、副主任2名（正科级）及副科级职数5名。