有“三部一室”，即组织部、宣传部、社会服务部、参政议政室。基层组织中有1个总支，10个支部，即分宜总支、渝水支部、市综合一支部、市综合二支部、市综合三支部、市综合四支部、高新支部、新钢支部、市人民医院支部、市中医院支部、新余学院支部。

截至2020年12月底，农工党新余市委会共有党员258名，其中，医卫界124人，占48·1％，教育界40人，占15·5％，人口资源与生态环境5人，占1·9％，其他为89人，占34·5％；具有中、高级职称143人，占55·4%，在职党员194人，占75·2%。有省政协委员1人，市人大代表4人，其中常委2人；市政协委员19人，其中副主席1人，常委2人。

2020年12月，被评为农工党抗击新冠肺炎疫情先进集体。