校本部

石河子大学石河子校区（校本部）位于新疆维吾尔自治区石河子市北四路221号。北三路、北四路将石河子大学（校本部）的校园分成为北区、中区、南区三个部分，校园总面积约114万平方米（截至2009年）。石河子校区拥有图书馆、体育馆、游泳馆、田径馆、会堂、博物馆等一批建筑。

石河子大学

新疆维吾尔自治区石河子市北四路221号

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北苑校区

石河子大学北苑新区位于新疆石河子市向阳街道北五路，是该校支撑教学科研的重要校区，2022年已有近4000名学生在此完成学习生活。校区内现坐落四个学院，分别为水利建筑工程学院、机械电气工程学院、农学院、动物科技学院。

石河子大学-北苑新区

新疆维吾尔自治区石河子市北四路221号石河子大学

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南山校区

石河子大学南山校区位于石河子市高新技术产业园内，在石河子市南六路至南八路、东三路至东五路之间，地理位置优越，交通便利。校区占地1440亩，毗邻石河子第一中学、师市党委党校、西北航空职业技术学校、天翔航空学院、天山雄鹰航空学院和新疆农垦科学院国家棉花研发中心。

兵团六建(石河子大学南山校区)

新疆维吾尔自治区石河子市石河子镇

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东苑校区

石河子大学东校区位于新疆石河子市北四路220号，设有经济与管理学院。

石河子大学-东区

石河子市石河子大学内

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五家渠校区

石河子大学五家渠校区位于新疆五家渠市前进东街109号。2024年，根据石河子大学定位定向的决策部署，五家渠校区规划为石河子大学承担非学历继续教育的主要园区；学院职能进一步确定为立足五家渠校区，以非学历教育、在职培训为主，学历提升教育为辅，逐步组织开展继续教育，推进应用型人才培养基地内涵建设。