2002年12月16日，西安建筑科技大学科教产业有限公司、陕西省物资集团将原陕西钢厂厂区划分为三大园区—教育区、开发区、工业生产区，其中教育园区以两院为基础，筹备建设华清学院；12月25日，学生1号、2号宿舍楼正式动工。

2003年4月，西安建筑科技大学党委常委会依据教育部8号文件，同意筹建申报独立学院；4月23日，西安建筑科技大学正式向省教委递交申请，申报成立“西安建筑科技大学科技学院”；12月，改名为“西安建筑科技大学华清学院”。

2004年5月10日，教育部正式批准成立西安建筑科技大学华清学院；7月，面向陕西省首次招生。

2005年，通过教育部对独立学院的专项检查。

2006年9月3日，经院长办公会研究，决定成立西安建筑科技大学华清学院建筑系、土木工程系、管理工程系、环境工程系、材料与治金系、机械电子工程系、经济贸易系等七个系。

2010年3月16日，学校党委硏究决定成立西安建筑科技大学华清学院党校。

2011年4月2日，学校爱国主义教育基地在富平县习仲勋陵园揭牌成立。

2012年，成为全国首批获得学士学位授予权的独立学院。

2014年7月22日，经院长力公会研究决定，将各系调整为建筑与艺术系、经济贸易系、土木工程系、环境工程系、机械电子工程系、信息与控制工程系、材料与矿资工程系、冶金工程系共八个系。

2017年3月21日，学校工程训练中心启用。

2019年，学校机电控制实验中心正式揭牌并投入使用。