医院先后荣获卫生部、联合国儿童基金会、世界卫生组织联合授予的《爱婴医院》称号，成为陕西省首家三级甲等医院并在多次复审中名列前茅，荣获全国首批《百佳医院》、行业文明“示范单位”和医院行风建设“先进单位”；医院护理部荣获全国妇联、国家卫计委联合颁发的全国卫生系统“巾帼文明岗”荣誉称号；医院多次被评为陕西省卫生系统“创佳评差”最佳单位；肾移植科、肝胆外科被团中央、卫生部授予永久性全国“青年文明号”单位。

2004年医院护理工作通过iso9000国际质量认证。

2014年，医院被陕西省卫计委授予陕西省“群众满意的医疗卫生机构”，被评为陕西省教育系统、卫生系统唯一的“第十届全国职工职业道德建设标兵单位”和“陕西省职工职业道德建设标兵单位”。

医院2015年检验科通过中国合格评定国家认可委员会is15189评审并获得认证。

2017年11月1日，西安交通大学第一附属医院获评得“2017年度全国改善医疗服务优秀医院管理者”。

2020年6月，入选“最美逆行者”优秀案例征集评选活动杰出奉献机构名单。

2020年9月8日，获评全国抗击新冠肺炎疫情先进集体。

2020年12月，入选2019-2020年节约型公共机构示范单位名单。

2021年4月19日，西安交通大学医学院第一附属医院重症医学科被中华全国总工会授予“全国五一巾帼标兵岗”荣誉称号。

2021年8月，西安交通大学第一附属医院内分泌代谢科被命名为“第20届全国青年文明号“。

2022年4月，西安交通大学第一附属医院心血管外科被授予第20届“陕西青年五四奖章集体”。